土地使用證顯示三層超過了怎么辦，1、如果土地是宅基地，那么要到村委會那里出證明，變更土地面積，然后拿證明和宅基地土地證到國土部門，辦理變更宅基地面積土地證。然后再拿變更面積后的土地證到房管局辦理宅基地房產證。2、如果土地是國有土地，那么，是
1、如果土地是宅基地，那么要到村委會那里出證明，變更土地面積，然后拿證明和宅基地土地證到國土部門，辦理變更宅基地面積土地證。然后再拿變更面積后的土地證到房管局辦理宅基地房產證。
2、如果土地是國有土地，那么，是辦理不了。超出面積的房屋是違法建筑，要被強行拆除的。只能把建造的房屋改建在土地證面積內，這樣你才可以辦理到房產證。
土地使用證和房產證的關系：
兩證應該是統一的，可持相關資料去做變更。現實操作中，大多業主手中只有房屋產權證，但如果國土證在業主自己手里的話，應該一致，否則會影響房屋出售。只有擁有房產證和土地使用證才能稱之為現房。
按規定，期房購買應使用商品房買賣的標準合同，現房可以不用。在建的房子不難判定是期房，建好的房子是否就是現房呢?不一定!
按國家銷售“現房”的規定，已經蓋好的房子，不等于是“現房”，已經有人入住的房子也不等于是“現房”，而已領房產證和土地使用證的房子才叫“現房”。這種現房銷售已不再需要“銷售許可證”，而是要查看“房產證”，簽合同也不是必須使用商品房買賣標準合同。購買這種房子，對購房人有利的是可以做到眼見為實，但購房人的眼光可要敏銳點兒，千萬別心血來潮，買錯了“現房”比買期房更容易使自己陷入被動。
沒有土地使用證和房產證的房不管它是蓋好的還是有人居住的，仍要按期房銷售，購房人除了要查看預售許可證外，還要特別留意自己買的房子是否已經被抵押。有的人以為某個小區已有人入住，或入住的業主已經拿到房產證，就以為買這種房子就萬無一失了，實際上這里存在著某種誤解。購房人一定要清楚房子按套擁有獨立產權，可以分別抵押，別人的房子沒問題，不等于您要買的房子也沒問題。其實，房子蓋好了又沒有預售出去，被抵押的可能性更大。
還有一種情況，就是“尾房”。房子蓋好了，還剩幾套沒賣出去，預售許可證過期了，房產證又沒辦下來，這種“無證”房不能說絕對不能買，但買時一定要查清楚，最好的辦法是堅持預售合同登記備案后再付款，不見兔子絕不撒鷹。
購房人特別要注意的是北京市國土資源和房屋管理局關于印發《〈北京市城市房地產轉讓管理辦法〉實施意見》的通知中的新規定：“商品房竣工后，房地產開發企業應當按規定時限申請辦理房地產權屬證書，并自取得房地產權屬證書之日起，持房屋所有權證書和土地使用權證書進行商品房現房銷售。商品房竣工后，房地產開發企業未取得房地產權屬證書的，可自商品房取得竣工備案表之日起四個月內繼續進行商品房預售;但自取得竣工備案表之日起超過四個月的，不得進行商品房預售?！边@個規定等于說現在有一種已建好的房子，預售許可證本身沒有過期，但由于取得竣工備案表4個月而沒拿下房產證是不能銷售的。
農村土地使用證辦理程序
一、申請
1、由農村村民個人向所屬鄉鎮國土資源管理所提出申請，領取土地登記申請審批表。
2、提交個人身份證或農村居民戶口簿復印件一份。3、土地權屬材料（82年5月14日以前，提交村、隊權屬來源證明書；82年5月14日以后，提交農村建房使用證；97年4月以后提交農村建房申請書、農村建設用地批準書等）。
二、調查
由鄉鎮國土資源管理所對申請者的用地進行地籍調查、地籍測量、申請人現場指界、鄰宗地簽字蓋章，填寫地籍調查表，繪制宗地草圖。
三、審核先由鄉鎮國土資源管理所進行審核，再報縣國土資源局審核，審核用地材料是否合法，用地界線是否無爭議，用地面積是否準確。四、審批
經審核符合“用地面積清楚，界址準確，權屬合法，無爭議”原則的，可批準并進行張榜公布，在公布一個月內無單位或個人對其提出爭議的，由縣人民政府頒發集體土地使用證。
土地使用證過戶程序：持土地使用權轉讓協議，以及雙方的身份證明，到土地部門辦理。土地使用證變更：根據《中華人民共和國土地管理法實施條例》第六條，依法改變土地所有權、使用權的，因依法轉讓地上建筑物、構筑物等附著物導致土地使用權轉移的，必須向土地所在地的縣級以上人民政府土地行政主管部門提出土地變更登記申請，由原土地登記機關依法進行土地所有權、使用權變更登記。土地所有權、使用權的變更，自變更登記之日起生效。依法改變土地用途的，必須持批準文件，向土地所在地的縣級以上人民政府土地行政主管部門提出土地變更登記申請，由原土地登記機關依法進行變更登記。根據《中華人民共和國城市房地產管理法》房地產轉讓或者變更時，應當向縣級以上地方人民政府房產管理部門申請房產變更登記，并憑變更后的房屋所有權證書向同級人民政府土地管理部門申請土地使用權變更登記，經同級人民政府土地管理部門核實，由同級人民政府更換或者更改土地使用權證書。
土地使用證過戶費用：
土地收益金，是指土地使用者將其所使用的土地使用權轉讓(含連同地面建筑物一同轉讓)給第三者時，就其轉讓土地交易額按規定比例向財政部門繳納的價款;或土地使用者將其所使用的土地使用權出租(含連同地面建筑物一同出租)給其他使用者時，就其所獲得的租金收入按規定比例向財政部門繳納的價款。土地出讓金，是指各級政府土地管理部門將土地使用權出讓給土地使用者，按規定向受讓人收取的土地出讓的全部價款(指土地出讓的交易總額);或土地使用期滿，土地使用者需要續期而向土地管理部門繳納的續期土地出讓價款;或原通過行政劃撥獲得土地使用權的土地使用者，將土地使用權有償轉讓、出租、抵押、作價入股和投資，按規定補交的土地出讓價款。土地增值稅，是指轉讓國有土地使用權、地上的建筑物及其附著物并取得收入的單位和個人，以轉讓所取得的收入包括貨幣收入、實物收入和其他收入為計稅依據向國家繳納的一種稅賦，不包括以繼承、贈與方式無償轉讓房地產的行為。土地使用稅，是指在城市、縣城、建制鎮、工礦區范圍內使用土地的單位和個人，以實際占用的土地面積為計稅依據，依照規定由土地所在地的稅務機關征收的一種稅賦。土地開發費，是指每公頃居住區用地開發所需的前期工程的測算投資，包括征地、拆遷、各種補償、平整土地、敷設外部市政管線設施和道路工程等各項費用。
北京圣運律師網小編提醒大家，對于建筑層數一定要按照土地使用證上的進行修剪，否則很有可能會遭遇一些罰款等行為的處罰，如有更多相關的法律問題，可以咨詢北京圣運律師網。
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內容審核：李軒教授
來源：頭條-土地使用證顯示三層超過了怎么辦，
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